作物体内的酵素种类很多，但用于商业用途的酶仅有200 多种，仅占作物体内酶总量的 10%。酶在农业上具有广泛的用途:

（1）用于果蔬保鲜。利用葡萄糖氧化酶可以进行果蔬除氧保鲜，溶菌酶可以进行灭菌保鲜。

（2）用于农产品加工。木瓜蛋白酶常被大量用作啤酒、果汁饮料等的澄清剂。以去除其在储藏过程中出现浑浊现象；木瓜蛋白酶还可用作肉类软化剂。利用葡萄糖异构酶转化果糖制成葡果糖浆。在糖果和糕点中应用。

（3）用于农产品质量检测。利用胆碱酯酶抑制剂法可快速检测衣产品中有机磷农药残留量。

（4）用作饲料添加剂。在饲料中加入酶制剂，会辅助动物消化吸收，从而提高饲料报酬,增强机休免疫力,提高养殖效益。

（5）用于生产维生素，以山梨酸为原料。经微生物氧化法生产维生素C。